深圳市中醫院始建于1975年，包含光明院區、福田院區、針灸分院和科教中心“一院四區”，下屬機構有深圳市中醫藥研究所、深圳市國際中醫藥人才培訓中心、深圳市中藥制劑中心。醫院于1995年成為三級甲等中醫醫院;1998年成為廣州中醫藥大學首家非直屬附屬醫院;2012年成為廣州中醫藥大學第四臨床醫學院。

醫院現有職工2000余人，其中衛生技術人員近1700人，高級職稱600余人，國家、省、市名中醫40余人。醫院醫療設備總值超過6億元，擁有多臺科研型MRI和CT機、數字一體化手術室、3D腹腔鏡、四維高端彩超等高精尖醫療設備。目前，醫院年門急診量200萬余人次，開放床位近1000張，年出院病人3.7萬余人次，已成為集醫療、教學、科研、預防、保健、康復為一體的大型綜合性三級甲等中醫醫院。

醫院重視中醫內涵建設，已形成國家、省、市重點專科梯隊，現有衛計委國家臨床重點專科2個(肝病科、腎病科);國家中醫藥重點學科2個(中醫肝膽病學、中醫腎病學);國家中醫重點專科3個(肝病科、腎病科、針灸科)，國家中醫重點專科建設單位3個(脾胃專科、內分泌專科、神志專科);省中醫名科4個;省中醫重點專科12個;深圳市醫學重點學科3個;市中醫特色專科19個。

醫院堅持“科教興院”戰略，擁有國家中醫藥管理局中醫藥科研三級實驗室——臨床細胞分子生物學實驗室、國家藥物臨床實驗基地(獲認定8個專業)、中華中醫藥學會臨床藥師培訓基地、深圳市民生重點實驗室——針灸現代應用研究實驗室、深圳市醫院中藥制劑研究重點實驗室、3個市醫管中心醫學科技創新平臺，入選國家中醫藥傳承創新工程備選項目。在研課題160余項，醫院牽頭承擔“十一五”、“十二五”、“十三五”科技重大專項各1項;國家自然科學基金科研課題30余項，獲得國家省市科技進步獎30余項。醫院先后成為廣州中醫藥大學博士后科研流動站研究基地，廣東省和深圳市“博士后創新實踐基地”、“廣東省聯合培養研究生示范基地”、國家“博士后科研工作站”、國家住院醫師規范化培訓主基地，現有19位博士生導師、63位碩士生導師，有36個臨床教研室，已形成博士、碩士、本科多層次的教學體系。在對外交流方面，醫院先后與美國Thomas Jefferson 大學、德國Medical Park康復醫院建立協作關系，與香港中文大學中醫學院、香港浸會大學中醫學院、香港執業中醫師學會、香港中醫學會會立中醫學院、香港國際針灸學院等建立了固定的教學協作及學術交流關系;20多個專業學術團體掛靠醫院成立。

醫院非常重視加強中醫藥文化建設，開展中醫“固本強基”工程，培養鐵桿中醫，樹立"心中有愛，服務有情"的服務理念和"大醫精誠，懸壺濟世"的醫德觀，形成和諧的工作氛圍，醫院先后被授予“國家示范中醫院”、“廣東省示范中醫院”、“廣東省百家文明醫院”、“廣東省文明中醫院”、“廣東中醫藥強省項目中醫名院”、“全國中醫醫院中醫藥文化建設示范單位”及“全國衛生文化先進單位”、“全國中醫藥系統創先爭優先進集體”、“全國模范職工之家”、“廣東省五一勞動獎狀”、“廣東省先進集體”、 國家中醫藥管理局傳統醫藥國際交流中心合作基地等稱號。多次在廣東省組織的醫院滿意度和醫德醫風測評中名列前茅，被媒體譽為“醫德醫風好，醫療質量高，醫療費用相對低廉，是市民信得過醫院”。